Shusuis Aufnahme in die ANBU endet tragisch: Er stirbt. Sein Tod hat Folgen, denn durch die darauffolgende Beförderung Itachis kommen er und der Uchiha-Clan sich freundschaftlich näher und verschwören sich gegen einen alten Feind ...

Itachi ist in tiefer Trauer wegen des Todes seines Freundes und reagiert deshalb heftiger als nötig, als ihn sein Vater für das Sharingan lobt, das er nur wegen des emotionalen Stress' heraufbeschwören konnte.

Die Dorfbewohner, inklusive Itachi und Sasuke, müssen sich in Sicherheit bringen, denn Obito aktiviert das Kyuubi und es ist auf totale Zerstörung aus. Alle müssen sich in den Schutzbunker retten, doch nicht jeder schafft es ...

Es geht den Teams traumhaft: Da Madaras Mugen Tsukuyomi immer noch wirkt, befinden sich alle in einem Traumzustand, der ihre tiefsten Wünsche und Verlangen offenbart. Wer findet aus der Traumwelt heraus, um seine Freunde aus diesem Zustand zu befreien?

Narutos und Sasukes Kampf ist beendet, dennoch sieht Sasuke keinen Grund mit Naruto zurück ins Dorf zu kehren. Das führt zu einem erneuten Kampf, wobei sich ihr Schicksal, Feinde zu sein, offenbart.

Orochimaru ist tot und Sasuke zur anderen Seite übergelaufen. Diese Informationen gibt Tsunade den Kriegern weiter, als wieder Ruhe in das Dorf einkehrt. Die Teams werden aufgeteilt und auf Missionen geschickt, als Team 7 überraschenden Zuwachs bekommt ...

Naruto hat sich in Pains zweiten Mond in das Kyuubi verwandelt, das Amok läuft. Dank Narutos Siegel kann es dennoch keinen großen Schaden anrichten, aber es muss unbedingt beruhigt werden. Wer kann nah genug an Narutos Inneres herantreten?

Shikamaru und die anderen Ausreißer finden Naruto bewusstlos auf der Turmspitze, der letzte Angriff war zu viel für ihn. Doch ihnen bleibt nicht lange Zeit, um sich die Wunden zu lecken: Sasuke ist wieder verschwunden.

Neji ist zurückgeblieben und kämpft gegen die ANBU-Ne, um den anderen den Vorsprung zu sichern. Es sind nur noch zwei Angreifer übrig, doch die werden seine größte Herausforderung in diesem Kampf.