Sumire wird in ein Forschungsteam versetzt, worüber ihre Teamkollegen untröstlich sind. Doch es gibt bereits Ersatz für das Mädchen - eine Samurai aus dem Eisenreich.

Nach dem Kampf gegen Urashiki können Boruto und Sasuke endlich wieder in ihre eigene Zeit zurückreisen. Doch zuvor muss die Erinnerung an die beiden erst aus den Gedächtnissen der Dorfbewohner gelöscht werden.

Boruto, Naruto und Jiraiya kämpfen weiterhin gegen Urashiki und stehen kurz vor dem Sieg. Doch dann greift der Otsutsuki plötzlich zu einem unerwarteten Mittel und verwandelt sich in ein noch viel stärkeres Wesen.

Boruto, Naruto, Jiraiya und Sasuke stehen Urashiki ein weiteres Mal im Kampf gegenüber. Und sie scheinen dem Otsutsuki weit unterlegen zu sein, denn dieser behauptet, in die Zukunft blicken und so jeden ihrer Schritte vorhersehen zu können.

Das Vater-Sohn-Training geht weiter und Boruto möchte noch mehr über die Bewohner Konohas erfahren - vor allem darüber, was mit dem Vergangenheits-Sasuke passiert ist. Währenddessen beginnt Jiraiya an der Geschichte von Boruto und Sasuke zu zweifeln.

Nach Urashikis Angriff beschließt Jiraiya, Boruto und Naruto gemeinsam zu trainieren. Die beiden Jungen sollen lernen, ihre Chakras miteinander zu synchronisieren. Doch Boruto hat Angst vor der Macht des Neunschwänzigen.

Boruto freundet sich in der Vergangenheit mit seinem jungen Vater an und die beiden treffen in der Stadt Konoha auf allerlei bekannte Gesichter. Als die Genin dann vom Hokage einen Auftrag bekommen, hilft auch Boruto mit aus.

Urashiki taucht plötzlich in der Vergangenheit auf und überrascht Boruto, Naruto und Sasuke. Der Otsutsuki will Naruto nun endlich das Chakra des Neunschwänzigen entreißen. Als der Versuch jedoch scheitert, entführt er den jungen Ninja kurzerhand ...

Durch das Relikt der Otsutsuki sind Boruto und Sasuke im Konoha der Vergangenheit gelandet. Sie finden schon bald heraus, dass Urashiki Naruto als Kind angreifen will, um an das Fuchs-Chakra zu gelangen. Um dies zu verhindern, muss Boruto Naruto finden

Naruto bereitet sein Dorf auf einen potenziellen Angriff von Urashiki vor. Dieser hat es auf das Chakra des Monsterfuchses abgesehen, der in Naruto steckt. Während sich alle zum Kampf bereitmachen, muss Boruto zurückbleiben.